主要来源于混合液中的大分子有机物(多糖、蛋白质等)，腐殖酸类，微生物絮体、细胞碎片等。其中溶解性有机物SMP、EPS虽然对于MLSS来说占比非常低，但是它们所造成的膜污染占到26%-52%。微生物在膜孔内及膜表面生长、吸附作用也是膜污染的重要因素。
由金属盐类，无机盐离子架桥作用形成。膜的常见无机污染主要是钙、镁、铁、硅等的碳酸盐、硫酸盐及硅酸盐的结垢物质，其中碳酸钙、硫酸钙、氢氧化镁较多。
3、膜污染的影响因素及其控制
膜污染的形成主要因素有：膜固有性质、混合液性质和系统运行环境，控制及解决膜污染也应该从这三方面采取相应的措施。
膜的固有性质
膜的物理及其化学性能是由膜材料决定的，膜在混合液中的抗污染能力与其材料有关。有研究表明膜的亲水性对抗污染能力有非常重要的影响。在有机膜材料中，有的是亲水性材质如PAN，大多数均为疏水性材质，像PVDF、PE、PS等。疏水性有机材料在应用时必须进行亲水性改造，由于改造工艺的差异，亲水性在使用过程中的流失就有了快慢之分。
此外，膜抗污染能力还与膜表面粗糙度、膜表面电荷、膜孔径等均有关系。一般来说，可以通过选择亲水性更好的膜材料，改善膜表面的粗糙度，选用与混合液电位相同的膜材料和合适的膜孔径来改善膜抗污染的能力。
无机膜如陶瓷膜：以氧化铝、碳化硅、氧化钛、氧化锆等为原料，高温烧结而成，在通量、强度、化学稳定性方便比有机膜具有明显的优势。
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